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南京信帆生物:DNA分子的限制性內(nèi)切酶消化操作流程
更新時(shí)間:2016-04-20   點(diǎn)擊次數(shù):1833次

 

一、限制性內(nèi)切酶對(duì)DNA消化的方案

1.限制性內(nèi)切酶反應(yīng)在滅菌的0.5ml離心管中進(jìn)行。

2. 20μl體積反應(yīng)體系如下:

DNA 0.2-1 μg

10×酶切buffer 2.0 μl

限制性內(nèi)切酶 1-2 u(單位)

加ddH2O 至 20 μl

限制性內(nèi)切酶zui后加入,輕輕混勻,稍加離心,放置于zui適溫度水浴并按所需的時(shí)間溫育,一般為37℃水浴消化3hr。

3.用于回收酶切片段時(shí),反應(yīng)總體積可達(dá)50-200μl,各反應(yīng)組分需相應(yīng)增加。

4.多種酶消化時(shí)若緩沖液條件相同,可同時(shí)加入;否則,先做低溫或低鹽的酶消化,再做高溫或高鹽的酶消化。

5.酶切結(jié)束時(shí),加入0.5M EDTA(pH 8.0)使終濃度達(dá)10mM,以終止反應(yīng)。或?qū)⒎磻?yīng)管在65℃水浴放置10min以滅活限制性內(nèi)切酶活性。

6.如消化反應(yīng)體積過(guò)大,電泳時(shí)加樣孔盛不下,可加以濃縮:終止反應(yīng)后,加入0.6體積的5M乙酸銨(或1/10體積3M NaAc)和2倍體積無(wú)水乙醇,在冰上放置5min,然后于4℃離心12000g× 5min。傾去含大部分蛋白質(zhì)的上清液。于室溫晾干DNA沉淀后溶于適量TE中(pH 7.6)。

7.如要純化消化后的DNA,可用等體積酚/氯仿(1∶1)和氯仿各抽提一次,再用乙醇沉淀。

二、電泳檢測(cè)

取質(zhì)粒酶切產(chǎn)物適量,加適當(dāng)loading buffer混勻上樣,以未經(jīng)酶切的質(zhì)粒或/和酶切的空載體(如有)作對(duì)照,采用 1-5V/cm的電壓,使DNA分子從負(fù)極向正極移動(dòng),至合適位置取出置紫外燈下檢測(cè),攝片。

三、注意事項(xiàng)

1. 濃縮的限制性內(nèi)切酶可在使用前以1×限制酶緩沖液稀釋,切勿用水稀釋以免酶變性。

2. 購(gòu)買的限制性內(nèi)切酶多保存于50%甘油中,于-20℃是穩(wěn)定的。進(jìn)行酶切消化時(shí),將除酶以外的所有反應(yīng)成分加入后即混勻,再?gòu)?20℃冰箱中取出酶,立即放置于冰上。每次取酶時(shí)都應(yīng)更換一個(gè)無(wú)菌吸頭,以免酶被污染。加酶的操作盡可能快,用完后立即將酶放回-20℃冰箱。

3.盡量減少反應(yīng)體積,但要確保酶體積不超過(guò)反應(yīng)總體積的10%,否則酶活性將受到甘油的抑制。

4.通常延長(zhǎng)時(shí)間可使所需的酶量減少,在切割大量DNA時(shí)可用。在消化過(guò)程中可取少量反應(yīng)液進(jìn)行微量凝膠電泳以檢測(cè)消化進(jìn)程。

5.注意星號(hào)酶切活力。

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